NIPT (non-invasive prenatal testing) is not a definitive test. It is possible for a positive diagnosis to be a ‘false positive’, meaning that the baby is negative but is diagnosed as positive for a variety of reasons. For this reason, we recommend that those who test positive have an amniotic fluid test as a definitive test.
Amniotic fluid testing at Tokyo Clinical Laboratory
Tokyo Clinical Laboratory offers real-time PCR testing for amniotic fluid. This is a PCR test for trisomies 21, 18, and 13 in amniotic fluid.
Whether to perform a real-time PCR test or exosome analysis will be decided by the Tokyo Sanitary Inspection Center depending on the detected disease.
Real-Time PCR Test
Real-time PCR testing of amniotic fluid is determined by exponentially increasing the number of target gene sequence molecules and measuring the amount of genes.
What is the advantage?
The G-band method, which is often used in amniotic fluid testing, requires cell culture, which takes time.
The advantage of the real-time PCR test is that it does not require cell culture and provides results in a relatively short period of time.
What does it test for?
Abnormalities in the number of chromosomes (trisomy, monosomy, etc.)
- Detection of the presence or absence of abnormal number of chromosomes (trisomy, monosomy, etc.)
エクソーム解析
DNA（またはｍRNA）のうちアミノ酸に置換される領域を「エクソン領域」、それ以外を「イントロン領域」と呼びます。エクソーム解析は、このエクソン領域のみを濃縮して解析することで、効率的に遺伝子の異常を検出する検査です。
利点
エクソン領域の1塩基の変化もとらえることができるため、部分欠失症候群や部分重複症候群といった疾患の原因遺伝子の同定も可能となります。
検査項目
エクソーム解析で検出される検査項目は下記の通りです
- 染色体の数の異常（トリソミー、モノソミーなど）の有無の検出
- 部分欠失症候群、部分重複症候群の有無の検出（ただし700万塩基未満）
エクソーム解析とは
1990年からアメリカが主導となり日本を始め各国の協力によって行われたヒトゲノム計画は、ヒトのDNA情報を全て解析することを目的とした国際プロジェクトでしたが、およそ3,000億円もの費用と10年以上の歳月を要した非常に大規模なものでした。当時の技術では個人単位でヒトゲノムの全DNA配列を解析することはコスト的、時間的にも非常に困難と考えられていました。しかし、21世紀に入り遺伝子解析の分野では急速に技術革新が進み、次世代シークエンサー（Next Generation Sequenser: NGS）と呼ばれる最新機器による解析が広まってきました。次世代シークエンサーの登場により、DNAの塩基配列を高速かつ正確、安価に解析することが可能となり、コスト的には100万分の1以下、時間的には1週間程度の時間でヒトゲノムの全DNA配列を解析することができるようになってきました。
次世代シークエンサーによる解析については、上でお話したようにどの領域のDNA配列を調べるかによって、いくつかの解析手法があります。
具体的には、30億にも及ぶ全てのDNA配列を調べる全ゲノム解析、タンパク質に翻訳される「エクソン」の領域を解析するエクソーム解析、その他には特定の疾患に関連した遺伝子をいくつかまとめて解析するパネルシークエンスなどの解析法があります。全てのDNA配列を解析する全ゲノム解析は、文字通り全ての遺伝子異常を検索することが可能ですが、遺伝的疾患の原因となる変異のほとんどは、全ゲノムのたった1-2%を占めるに過ぎないエクソン領域に存在すると考えられており、コストや時間などの効率面を考慮するとエクソーム解析が有用である場面も多いです。
What is an amniotic fluid test?
Common amniotic fluid tests conventionally performed include specific genetic analysis methods such as the chromosome banding method and FISH method. These tests can reveal the presence or absence of relatively rough genetic abnormalities such as abnormal chromosome numbers or structural abnormalities (inversions, translocations, large deletions or duplications), such as the trisomy 21 trisomy that causes Down syndrome.
However, it is difficult to comprehensively detect microscopic structural abnormalities in genes with conventional testing methods, and numerous genetic abnormalities are likely to be missed. Therefore, a new era is coming in which comprehensive analysis by exome analysis and whole genome analysis using next-generation sequencers that can detect DNA sequence abnormalities in a wide range of regions on a one-by-one basis will be highly demanded.
As for the collection of amniotic fluid samples, it is possible to analyze the genes of fetal-derived cells from a small amount of amniotic fluid in the same way as with the conventional method. Compared to the conventional method, there is no significant burden on the patient.
Do you want to undergo Amniotic Fluid Testing?
After consulting with your obstetrician about the amniotic fluid test and once you have made a request, please send your amniotic fluid to Tokyo Clinical Laboratory. If you are denied for the test, we can provide you with information on facilities that perform the test.
Do not hesitate to contact us for more information.
How to collect Amniotic Fluid?
- Collect 15 ml of amniotic fluid in a 15 ml sterile tube provided by the amniotic fluid collection medical facility.
- Place it in a 50 ml tube and wrap the screw cap with Parafilm.
- Place in biohazardous vinyl with zipper and wrap with absorbent sheet.
- Please keep refrigerated until it is collected.
